对细菌、真菌、动物和植物中的6mA甲基转移酶基因的系统进化分析及染色体定位表明,森林草莓MT-A70基因可分为3个亚家族,且在动、植物分化前就已经存在:两个DAMT基因由物种特异的串联重复产生,且结构变化快,推测其在进化历程中功能发生了分化。转录组数据及实时定量荧光PCR分析显示,各个基因均具有时空表达特异性和非生物胁迫响应。其中1个DAMT基因表达量在果Selleck实中较高且随果实成熟上调,推测可能参与调控果实成熟。此外,这5个在冷胁迫下表达水平有不同程度下调:而在热胁迫下随着胁迫时间而有显著变化。由此推测6mA甲基转移酶基因可能参与了森林草莓的生长发育和对冷、热胁迫的响应。
富民枳是云南特有的极小种群野生植物,野生资源仅剩15株。通过二代测序技术,对其进行简化基因组测序,开通常发一批特异性高的单核苷酸多态性标记,分析天然种群和回归种群的遗传多样性。经过遗传变异检测,共获得SNP位点491 189个,通过样品最低测序深度>2,样品缺失率<0.5、次要基因型频率(MAF)>0.05筛选以后,得到有效SNP位点41 077个。基于过滤后的SNP,运用生物信息学分析方法,对富民枳完成了群体的遗传多样性分析,研究很少分析了富民枳天然种群和回归种群的私人等位基因数目、平均观测杂合度(H_o)、平均期望杂合度(H_e)、核苷酸多样性(π)和平均近交系数(F_(IS))5个遗传多样性参数。结果表明,富民枳现存植株的遗传多样性较高,具有很高的遗传资源保存价值,但是回归种群的H_o值、H_e值、π值分别为0.398 3、0.291和0.330 6,分别仅是天然种群遗传多样性的87%、78%和73%,并未达到90%以上遗传多样性的标准。